布鲁塞尔有各类博物馆70多家，其中最著名的有：
1. 比利时皇家美术博物馆(Royal Museums of Fine Arts of Belgium, Rue de La Regence 3, 1000 Brussels )
比利时皇家美术博物馆是比利时最重要的美术类博物馆之一，建成超过200年，位于布鲁塞尔市中心。共有四座博物馆隶属于皇家博物馆，其中两座(古代艺术博物馆和马格里特博物馆)位于主楼之内，另外两座（康斯坦丁·默尼耶博物馆和安东尼·维尔茨博物馆）相对较小，距市中心几公里外，专门展示比利时艺术家的作品。
皇家美术博物馆拥有15世纪至今、超过两万件的绘画、雕刻藏品，包括雅克-路易·大卫（Jacques-Louis David）的油画《马拉之死》。弗拉芒画派（Flemish painting）的丰富收藏包括老彼得·布吕赫尔、罗希尔·范·德韦登、罗伯特·康宾、安东尼·范·戴克、雅各布·乔登斯等名家作品。该馆“鲁本斯厅”藏有超过20幅鲁本斯油画。
马格里特博物馆（Musée Magritte Museum）以勒内·马格里特名字命名，于2009年6月揭幕。雷内·马格里特是比利时20世纪最有名的画家，也是世界十大超现实主义画家之一。馆内收藏玛格里特200多幅作品，如著名的《太阳帝国》《神秘的游戏者》和《回归》，以及马格里特的许多信件、照片、素描、水粉画、海报、他和朋友们拍摄的电影。
2. 比利时皇家艺术和历史博物馆(The Royal Museums of Art and History, Parc du Cinquantenaire 10)
比利时皇家艺术和历史博物馆位于布鲁塞尔五十周年公园附近。馆藏包括罗马帝国时代、古希腊时代和埃及的珍贵出土文物，代表中东和波斯古国艺术造诣的浮雕、铜盾等艺术品，以及许多来自南美、大洋洲、中国、东南亚的艺术珍品。
3. 布鲁塞尔漫画博物馆(Brussels COMICS Figurines Museum, Galerie Horta Marché aux Herbes 116, 1000 Brussels)
布鲁塞尔漫画博物馆展出比利时漫画（丁丁、斯皮鲁、蓝精灵等等）和其他外国漫画的藏品。观众可以通过视频游戏、视频讲解、老式电影院内的动画片放映等身临其境的体验感受这些漫画角色，唤起童年记忆。
4. 布鲁塞尔城市博物馆(musée de la ville de bruxelles, Grand-Place, 1000 City of Brussels)
布鲁塞尔市博物馆于1887年开放，位于该市的历史建筑“国王屋”内，主要收藏、保存布鲁塞尔市的历史及艺术遗产，藏品包括13世纪至今的绘画、雕塑、陶器等艺术品和文物。
5. 皇家军事博物馆(Royal Museum of the Armed Forces and of Military History, Parc du Cinquantenaire 3)
皇家军事博物馆，位于布鲁塞尔五十周年纪念公园的历史综合楼北端两个展厅。在1910年的展览上，军事史部分对公众开放并获得极大的赞誉。鉴于公众的热情，当局建立了一座军队博物馆。该馆最初设在坎布雷隐修院（Abbaye de La Cambre），后于1923年迁至五十周年纪念公园。
该馆拥有世界各国在各年代的制服、武器、交通工具及军事装备。戈登•波迪尤（Gédéon Bordiau）建造的北厅自1972年以来陈列航空领域的相关展品，包括各种航空器，其中有些历史可以追溯到20世纪初。
6.布鲁塞尔时装与蕾丝博物馆(Fashion & Lace Museum, Rue de la Violette 12, 1000 Brussels)
布鲁塞尔因蕾丝生产闻名。早在16世纪，比利时西部法兰德斯地区就出现了蕾丝编织技艺。棱结蕾丝（Bobbin lace）由生活在比利时西北部的布鲁日人发明，而针织蕾丝（Needle lace）起源于意大利，后来成为布鲁塞尔的特色产品。时装与蕾丝博物馆创立于1977年，主要收藏18世纪迄今的服装、传统与现代蕾丝、刺绣织物及时尚配饰等，展示布鲁塞尔的传统花边编织技艺与蕾丝行业的发展历史。
20世纪中叶，位于大王宫广场的布鲁塞尔城市博物馆收藏了一批蕾丝花边。1977年，布鲁塞尔市以这些藏品为基础，建立了一座“服装与蕾丝博物馆”（Costume & Lace Museum）。博物馆以布鲁塞尔市的传统蕾丝为基础，通过私人捐赠和购买等途径不断扩充馆藏，逐渐建立起18世纪迄今的欧洲时装藏品体系。2007年10月，建馆40周年之际更名为“时装与蕾丝博物馆”。
6. 自然科学博物馆(Museum of Natural Sciences, Rue Vautier 29, 1000 Brussels)
自然科学博物馆是儿童和成人的必游之地。在欧洲最大的恐龙展厅里，观众可以见到大名鼎鼎的伯尔尼萨特鬣齿龙。在人类展厅了解人体及其进化过程，在进化展厅回顾历史，在生物城了解城市物种，在自然科学厅观看展示博物馆历史的展品，还可以参观临时展览或体验社会教育的互动活动，体验新鲜事物。
7. 乐器博物馆(Musical Instruments Museum, Rue Montagne de la Cour 2, 1000 Brussels)
乐器博物馆坐落在艺术山（Mont des Arts）上一幢新艺术风格的老英格兰（Old England）建筑内，收藏有世界著名的乐器，观众可以欣赏到迄今所知最古老的萨克斯管、装饰精美的鲁克斯大键琴等。博物馆还拥有音乐厅、工作坊、艺术品商店和收藏了博物馆的图标和音像制品的图书馆。